Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSF3RQ99062 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms