Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms