Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms