Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms