Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
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