Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TPD52L3Q96J77 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms