Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms