Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EAF2Q96CJ1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms