Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.035e-9■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-9■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 FOXN3-207ENST00000555010 340 ntTSL 52.62□□□□□ -1.992e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 41.7
TBRG4Q969Z0 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 41.7
TBRG4Q969Z0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 41.7
TBRG4Q969Z0 TSPEAR-AS2-203ENST00000465978 345 ntTSL 511.98□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 41.7
TBRG4Q969Z0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.329e-7■■■■■ 41.6
TBRG4Q969Z0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 41.6
TBRG4Q969Z0 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 514.09□□□□□ -0.159e-7■■■■■ 41.6
TBRG4Q969Z0 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 216.62■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 41.6
TBRG4Q969Z0 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 41.5
TBRG4Q969Z0 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 318.54■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 41.5
TBRG4Q969Z0 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 325.38■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 323.01■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 521.62■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 321.29■■□□□ 12e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-211ENST00000529440 439 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-210ENST00000529151 898 ntTSL 312.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-221ENST00000532546 833 ntTSL 311.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-206ENST00000525920 497 ntTSL 311.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-222ENST00000533241 539 ntTSL 47.06□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 41.4
TBRG4Q969Z0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 IGF2BP2-205ENST00000461957 509 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 TGFBR3-203ENST00000417833 551 ntTSL 412.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 IGF2BP2-208ENST00000466476 469 ntTSL 211.81□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 IGF2BP2-209ENST00000493302 358 ntTSL 56.42□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 215.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 413.77□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 411.54□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 41.3
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TBRG4Q969Z0 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 48.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 46.56□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 SCART1-205ENST00000488261 4709 ntTSL 221.02■□□□□ 0.951e-9■■■■■ 41.3
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TBRG4Q969Z0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 SCART1-201ENST00000462252 3451 ntTSL 216.05■□□□□ 0.161e-9■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 314.63□□□□□ -0.071e-9■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 41.3
TBRG4Q969Z0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-214ENST00000569441 1428 ntTSL 530.05■■■□□ 2.44e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-212ENST00000568689 1998 ntTSL 329.45■■■□□ 2.314e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-209ENST00000567120 2205 ntTSL 1 (best)27.94■■■□□ 2.064e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.044e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.854e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.844e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TEX261-206ENST00000489894 590 ntTSL 226.41■■□□□ 1.824e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.694e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AK4-206ENST00000497030 834 ntTSL 1 (best)25.52■■□□□ 1.684e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)24.41■■□□□ 1.54e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.384e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 323.58■■□□□ 1.371e-8■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.354e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.354e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)23.41■■□□□ 1.344e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AK4-203ENST00000470888 1043 ntTSL 222.96■■□□□ 1.274e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.254e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 C9orf3-215ENST00000478473 895 ntTSL 322.81■■□□□ 1.241e-8■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-205ENST00000539468 2186 ntTSL 522.8■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 222.56■■□□□ 1.24e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.24e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-207ENST00000565302 1975 ntTSL 322.32■■□□□ 1.164e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 COQ9-215ENST00000568790 1027 ntTSL 222.29■■□□□ 1.164e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 C9orf3-209ENST00000460573 443 ntTSL 522.23■■□□□ 1.151e-8■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 COQ9-207ENST00000564655 935 ntTSL 322.18■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 C9orf3-216ENST00000478603 802 ntTSL 222.1■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 C9orf3-213ENST00000471978 478 ntTSL 221.84■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TEX261-204ENST00000473055 461 ntTSL 321.48■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 COQ9-206ENST00000564115 845 ntTSL 521.33■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.954e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 COQ9-208ENST00000565964 581 ntTSL 320.8■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 41.2
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