Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms