Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms