Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA2Q8TDQ7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms