Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms