Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms