Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms