Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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DTX3Q8N9I9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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DTX3Q8N9I9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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DTX3Q8N9I9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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DTX3Q8N9I9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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DTX3Q8N9I9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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DTX3Q8N9I9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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