Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms