Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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