Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNE4Q8N205 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms