Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms