Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms