Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms