Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms