Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms