Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms