Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms