Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RWDD4Q6NW29 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms