Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms