Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC7AQ5VTJ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC7AQ5VTJ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms