Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms