Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms