Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms