Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms