Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA8Q53HL2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms