Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC92Q53HC0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC92Q53HC0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC92Q53HC0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC92Q53HC0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC92Q53HC0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC92Q53HC0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC92Q53HC0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms