Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms