Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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