Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms