Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms