Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms