Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ME3Q16798 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME3Q16798 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME3Q16798 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME3Q16798 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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