Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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