Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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