Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms