Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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RAB35Q15286 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB35Q15286 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB35Q15286 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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