Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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