Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms