Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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AP3B2Q13367 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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AP3B2Q13367 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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