Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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