Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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